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Biophysics of RNA Folding (eBook)

Rick Russell (Herausgeber)

eBook Download: PDF
2012 | 2013
VI, 238 Seiten
Springer New York (Verlag)
978-1-4614-4954-6 (ISBN)

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Biophysics of RNA Folding -
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This volume, written by experts in the field, discusses the current understanding of the biophysical principles that govern RNA folding, with featured RNAs including the ribosomal RNAs, viral RNAs, and self-splicing introns. In addition to the fundamental features of RNA folding, the central experimental and computational approaches in the field are presented with an emphasis on their individual strengths and limitations, and how they can be combined to be more powerful than any method alone; these approaches include NMR, single molecule fluorescence, site-directed spin labeling, structure mapping, comparative sequence analysis, graph theory, course-grained 3D modeling, and more. This volume will be of interest to professional researchers and advanced students entering the field of RNA folding.


This volume, written by experts in the field, discusses the current understanding of the biophysical principles that govern RNA folding, with featured RNAs including the ribosomal RNAs, viral RNAs, and self-splicing introns. In addition to the fundamental features of RNA folding, the central experimental and computational approaches in the field are presented with an emphasis on their individual strengths and limitations, and how they can be combined to be more powerful than any method alone; these approaches include NMR, single molecule fluorescence, site-directed spin labeling, structure mapping, comparative sequence analysis, graph theory, course-grained 3D modeling, and more. This volume will be of interest to professional researchers and advanced students entering the field of RNA folding.

Chapter 1: IntroductionRick Russell Chapter 2: Comparative Analysis of the Higher-order Structure of RNARobin R. GutellChapter 3: Graph Applications to RNA Structure and FunctionNamhee Kim,  Katherine Niccole Fuhr,  Tamar SchlickChapter 4: Prediction and Coarse-Grained Modeling of RNA StructuresZhen Xia, Pengyu RenChapter 5: Studying RNA Folding Using Site-Directed Spin LabelingXiaojun Zhang, Peter Z. QinChapter 6: The RNA Recognition Motif and Messenger RNAKathleen B HallChapter 7: Memory Effects in RNA folding dynamics revealed by single molecule fluorescenceRui Zhao, David RuedaChapter 8: An integrated picture of HDV ribozyme catalysisBarbara L. Golden, Sharon Hammes-Schiffer, Paul R. Carey, Philip C. BevilacquaChapter 9: Combining biochemical and structural information to model RNA-protein complex assemblyMaithili Saoji, Chun Geng, Paul J. PaukstelisChapter 10: Following RNA Folding From Local and Global PerspectivesMichael Brenowitz, Lois PollackChapter 11: The Roles of Chaperones in RNA FoldingRick Russell

Erscheint lt. Verlag 9.12.2012
Reihe/Serie Biophysics for the Life Sciences
Biophysics for the Life Sciences
Zusatzinfo VI, 238 p.
Verlagsort New York
Sprache englisch
Themenwelt Studium 1. Studienabschnitt (Vorklinik) Biochemie / Molekularbiologie
Naturwissenschaften Biologie Genetik / Molekularbiologie
Naturwissenschaften Physik / Astronomie Angewandte Physik
Technik
ISBN-10 1-4614-4954-5 / 1461449545
ISBN-13 978-1-4614-4954-6 / 9781461449546
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