Comprehensive Reanalysis of Genomic Storm (Transcriptomic) Data, Integrating Clinical Varibles and Utilizing New and Old Approaches (eBook)
51 Seiten
GRIN Verlag
978-3-656-85844-7 (ISBN)
Methods: In retrospective large-scale data analysis, I applied (old and new methods), including lagged correlation between transcripts and clinical subtype counts (by integrating over 800 samples from trauma patients).
Results: Focussing on novel pathways and correlation methods we revealed (persistently down-regulated) ribosomal genes and changed time profiles of metabolic enzyme precursors /transcripts. Candidates associated to insulin signalling, including HK3, hinted towards “metabolic syndrome”. Correlation analysis yielded robust results for LCN2 and LTF (r>0.9), but only moderate associations to subtype counts (e.g. top-performing r (Eosinophil, IL5RA)>0.6).
Discussion: Gene Centred Normalisation Reduces Ambiguity and Improves Interpretation.
| Erscheint lt. Verlag | 12.12.2014 |
|---|---|
| Verlagsort | München |
| Sprache | englisch |
| Themenwelt | Mathematik / Informatik ► Informatik |
| Medizin / Pharmazie ► Allgemeines / Lexika | |
| Schlagworte | APPROACHES • Clinical • Comprehensive • Data • Genomic • integrating • Reanalysis • Storm • transcriptomic • utilizing • varibles |
| ISBN-10 | 3-656-85844-6 / 3656858446 |
| ISBN-13 | 978-3-656-85844-7 / 9783656858447 |
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