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Bioinformatics Programming in Python (eBook)

A Practical Course for Beginners
eBook Download: EPUB
2011 | 1. Auflage
X, 418 Seiten
Wiley-VCH (Verlag)
978-3-527-64490-2 (ISBN)

Lese- und Medienproben

Bioinformatics Programming in Python - Ruediger-Marcus Flaig
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This first introductory book designed to train novice programmers is based on a student course taught by the author, and has been optimized for biology students without previous experience in programming.
By interspersing theory chapters with numerous small and large programming exercises, the author quickly shows readers how to do their own programming, and throughout uses anecdotes and real-life examples from the biosciences to 'spice up' the text.
This practical book thus teaches essential programming skills for life scientists who want -- or need -- to write their own bioinformatics software tools. Sie sind Biologe, Molekularbiologe oder Genetiker? Sie wollen Ihre eigene Bioinformatik-Software schreiben? Und Sie haben keine Programmiererfahrung? Für Sie wurde dieses Buch verfasst! Theoretische Kapitel und kurze Programmierübungen wechseln einander ab, das Ganze ist garniert mit witzigen Anekdötchen und Beispielen aus dem "wirklichen Leben". Die verwendete Programmiersprache heißt Python und kann kostenlos aus dem Web heruntergeladen werden. An die Arbeit!

Rüdiger-Marcus Flaig studied Biology at the University of Heidelberg (Germany) where he obtained a Sc.D. degree, followed by a Ph.D. degree from the German Cancer Research Center. After postdoctoral work at the Universities of Gießen and Heidelberg he trained as a patent attorney and is now handling biotech patent applications for the European Patent Office in Munich. From 2003 to 2005 he developed and repeatedly taught a course on bioinformatics programming for biology students.

Classification of Programming Languages
Getting the Materials: Python program and documentation
Variables, Data Types, Assignments
Flow Control
Worked Example #1
Functions and Procedures
Worked Example #2
The Object-oriented World
Worked Example #3
Top-down Versus Bottom-up Strategies
Worked Example #4
Sorting and Searching
Welcome to the Library
Programming Exercise: Trimethizing a File
Dealing with Errors
Programming Exercise: Generating a Restriction Map
Advanced Techniques in Python
Programming Exercise: Python goes PCR

Erscheint lt. Verlag 5.10.2011
Sprache englisch
Themenwelt Mathematik / Informatik Informatik
Naturwissenschaften Biologie
Schlagworte Bioinformatics & Computational Biology • Bioinformatik • Bioinformatik u. Computersimulationen in der Biowissenschaften • Biowissenschaften • Computer Science • Genetics • Genetik • Informatik • Life Sciences • Programmierung (EDV) • Programmierung u. Software-Entwicklung • Programming & Software Development • Python (Programmiersprache)
ISBN-10 3-527-64490-3 / 3527644903
ISBN-13 978-3-527-64490-2 / 9783527644902
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