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Network Inference in Molecular Biology (eBook)

A Hands-on Framework
eBook Download: PDF
2012 | 2012
IX, 100 Seiten
Springer New York (Verlag)
978-1-4614-3113-8 (ISBN)

Lese- und Medienproben

Network Inference in Molecular Biology -  Jesse M. Lingeman,  Dennis Shasha
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Inferring gene regulatory networks is a difficult problem to solve due to the relative scarcity of data compared to the potential size of the networks. While researchers have developed techniques to find some of the underlying network structure, there is still no one-size-fits-all algorithm for every data set.

Network Inference in Molecular Biology examines the current techniques used by researchers, and provides key insights into which algorithms best fit a collection of data. Through a series of in-depth examples, the book also outlines how to mix-and-match algorithms, in order to create one tailored to a specific data situation.
Network Inference in Molecular Biology is intended for advanced-level students and researchers as a reference guide. Practitioners and professionals working in a related field will also find this book valuable.


Inferring gene regulatory networks is a difficult problem to solve due to the relative scarcity of data compared to the potential size of the networks. While researchers have developed techniques to find some of the underlying network structure, there is still no one-size-fits-all algorithm for every data set. Network Inference in Molecular Biology examines the current techniques used by researchers, and provides key insights into which algorithms best fit a collection of data. Through a series of in-depth examples, the book also outlines how to mix-and-match algorithms, in order to create one tailored to a specific data situation.Network Inference in Molecular Biology is intended for advanced-level students and researchers as a reference guide. Practitioners and professionals working in a related field will also find this book valuable.

The Gene Network Inference Problem.- Experimental Inputs.- Running Examples.- Overall Workflow of Inference.- Sample Pipelines.- Roll Your Own Pipeline.- Appendix.

Erscheint lt. Verlag 24.5.2012
Reihe/Serie SpringerBriefs in Electrical and Computer Engineering
SpringerBriefs in Electrical and Computer Engineering
Zusatzinfo IX, 100 p. 58 illus.
Verlagsort New York
Sprache englisch
Themenwelt Mathematik / Informatik Informatik Datenbanken
Mathematik / Informatik Informatik Programmiersprachen / -werkzeuge
Informatik Theorie / Studium Algorithmen
Naturwissenschaften Biologie Genetik / Molekularbiologie
Technik
Schlagworte Algorithm analysis and problem complexity • Clustering • gene regulatory networks • Knock-outs • Network inference • Overexpression
ISBN-10 1-4614-3113-1 / 1461431131
ISBN-13 978-1-4614-3113-8 / 9781461431138
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