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Systemic Lupus Erythematosus, An Issue of Rheumatic Disease Clinics -  Ellen M. Ginzler

Systemic Lupus Erythematosus, An Issue of Rheumatic Disease Clinics (eBook)

eBook Download: PDF | EPUB
2014 | 1. Auflage
185 Seiten
Elsevier Health Sciences (Verlag)
978-0-323-32388-8 (ISBN)
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In only the last four years, there have been dramatic changes in the understanding of the immunology, genetic/epigenetic associations, and identification of new targets for therapy in Systemic Lupus Erythematosus. The editors have enlisted a superb group of authors to present articles detailing cutting-edge advances in these areas.
In only the last four years, there have been dramatic changes in the understanding of the immunology, genetic/epigenetic associations, and identification of new targets for therapy in Systemic Lupus Erythematosus. The editors have enlisted a superb group of authors to present articles detailing cutting-edge advances in these areas.

Clinical Perspectives on Lupus Genetics


Advances and Opportunities


Judith A. James, MD, PhDabjudith-james@omrf.org,     aOklahoma Clinical & Translational Science Institute, University of Oklahoma Health Sciences Center, 920 Stanton L Young Boulevard, Oklahoma City, OK 73104, USA; bDepartments of Medicine, Pathology, Microbiology & Immunology, University of Oklahoma Health Sciences Center, 920 Stanton L Young Boulevard, Oklahoma City, OK 73104, USA

∗Department of Arthritis and Clinical Immunology, Oklahoma Medical Research Foundation, 825 Northeast 13th Street, Oklahoma City, OK 73104.

In recent years, genome-wide association studies have led to an expansion in the identification of regions containing confirmed genetic risk variants within complex human diseases, such as systemic lupus erythematosus (SLE). Many of the strongest SLE genetic associations can be divided into groups based on their potential roles in different processes implicated in lupus pathogenesis, including ubiquitination, DNA degradation, innate immunity, cellular immunity, lymphocyte development, and antigen presentation. Recent advances have also shown several genetic associations with SLE subphenotypes and subcriteria. Many areas for further exploration remain to move lupus genetic studies toward clinically informative end points.

Keywords

SLE

Lupus

Genetics

Clinical subphenotypes

GWAS

Nephritis

Autoantibodies

Key points


• Polymorphisms in genes important for ubiquitination, DNA degradation, innate immunity, cellular immunity, antigen presentation, and lymphocyte development are associated and confirmed in systemic lupus erythematosus (SLE).

• Select genetic associations are enriched in patients with SLE with certain autoantibodies, antiphospholipid syndrome, pericarditis, thrombosis, arthritis, or lupus nephritis.

• New lupus genetic studies are warranted, especially with large cohorts enriched for understudied races, and in patients with severe disease or poor prognosis.

• New lupus genetic studies are also warranted in large cohorts of patients with SLE with phenotype information about common lupus comorbidities and response to therapeutics.

Introduction


Systemic lupus erythematosus (SLE; lupus) is a complex clinical syndrome with a wide range of clinical symptoms and significant immune dysregulation including production of high concentrations of autoantibodies. Lupus cases have been found to cluster in families with 66% heritability and a lambda S between 8 and 29. Monozygotic twin studies have shown 24% to 69% twin concordance rates, compared with the dizygotic twin or sibling rates of 2% to 5%.13 Since the first genome-wide association studies (GWAS) conducted in SLE were published in 2008,46 the number of associated and confirmed genetic associations has increased greatly, as shown and referenced in Table 1, which summarizes these findings to December 2013.

Table 1

Loci associated with SLE through GWAS, meta-analysis studies, candidate gene studies, or replication studies from 1992 to December 2013

IKBKE NFκB signaling 1q32.1 rs1539241/rs12142086 EU 94
TNIP1 Ubiquitination in NFκB signaling 5q32 rs10036748 EU, AA, AS 4,15,23,77,95,96
TNFAIP3 Ubiquitination in NFκB signaling 6q23 rs2230926 EU, AA, AS 4,14,23,77,9799
SLC15A4 Ubiquitination in NFκB signaling 12q24.32 rs1385374 AS 15,23
UBASH3A Ubiquitination 21q22.3 rs9976767 EU 100
UBE2L3, HIC2 Ubiquitination in NFκB signaling 22q11.21 rs463426 EU, AS 5,23,101,102
IRAK1/MECP2 Ubiquitination in NFκB signaling Xq37 rs1734787 EU, HA, AS 4,77,103105
Complement genes Apoptosis/clearance of debris; neutrophil/monocyte immunity 1q36 Multiple EU 106110
IL-2/IL-21 Apoptosis/clearance of debris; neutrophil/monocyte immunity 4q26 rs907715 EU, AA, AS 111,112
ATG5 Apoptosis/clearance of debris 6q21 rs548234 EU, AS 4,5,23,77
ITGAM Apoptosis/clearance of debris 16p11.2 rs9888739 EU, HA, AS 46,77,103,113115
DNase 1 Apoptosis/clearance of debris 16p13.3 rs8176927 AS, A 116,117
ACP5/TRAP Apoptosis/clearance of debris 19p13.2 rs79525531 EU, AS, H 118
Mir146a mRNA stability/translation 6q5 rs57095329 EU, AA, AS 119,120
ZBP2 mRNA stability/translation 17q12 rs1453560 EU, AA 22
IFIH1 TLR/interferon pathways; T-cell immunity 2q24 rs1990760 EU 22
STAT4 TLR/interferon pathways; T-cell immunity 2q23.2 rs7582694 EU, HA, AA, AS 4,5,31,97,103,113,121123
RASGRP3 TLR/interferon pathways 2p24.1 rs13385731 AS 23
PRDM1 TLR/interferon pathways; B-cell immunity; T-cell immunity 6p21 rs6568431 EU 77
IRF5/TNPO3 TLR/interferon pathways 7q32 rs12537284 EU, HA, AA, AS 4,5,77,101,124126
PHRF1/IRF7/KIAA1542 TLR/interferon pathways 11p15.5 rs4963128 EU, AA 4,5,23,77
IRF8 TLR/interferon pathways; neutrophil/monocyte immunity 16q24.1 rs116440334 EU 22,127
TLR7 TLR/interferon pathways Xp22.3 rs3853839 EU, AS 128,129
UHRF1BP1 Cellular growth 6p21 rs11755393 EU 77
TNXB Cellular adhesion 6p21.32–33 rs310342 AS 130
PXK Synaptic transmission 3p14.3 rs6445975 EU 4,5,102,113
HIP1 Endocytosis and protein trafficking 7q11 rs6964720 AS 97
NCF2 B-cell immunity 1q25 rs17849502 EU, AS 4,77,111,131
IL-10 B-cell immunity; lymphocyte activation; neutrophil/monocyte immunity 1q31-q32 rs3024505 EU, AA, AS 4,77,101,103,132
BANK1 B-cell immunity 4q24 rs10513487 EU, HA, AA, AS 4,103,133,134
BLK B-cell immunity 8p3 rs7812879 EU, HA, AA, AS 5,6,23,97,135,136
LYN B-cell immunity 8q13 rs7829816 EU, AA, AS 5,137
ELF1 B-cell immunity; T-cell immunity 13q13 rs7329174 AS 138
PRKCB B-cell...

Erscheint lt. Verlag 28.8.2014
Sprache englisch
Themenwelt Medizinische Fachgebiete Innere Medizin Rheumatologie
ISBN-10 0-323-32388-X / 032332388X
ISBN-13 978-0-323-32388-8 / 9780323323888
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