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Analysis of RNA-Protein Complexes in vitro -

Analysis of RNA-Protein Complexes in vitro (eBook)

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1998 | 1. Auflage
248 Seiten
Elsevier Science (Verlag)
978-0-08-088696-1 (ISBN)
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The central role of RNA in many cellular processes, in biotechnology, and as pharmaceutical agents, has created an interest in experimental methods applied to RNA molecules. This book provides scientists with a comprehensive collection of thoroughly tested up-to-date manuals for investigating RNA-protein complexes in vitro. The protocols can be performed by researchers trained in standard molecular biological techniques and require a minimum of specialized equipment. The procedures include recommendation of suppliers of reagents.

The central role of RNA in many cellular processes, in biotechnology, and as pharmaceutical agents, has created an interest in experimental methods applied to RNA molecules. This book provides scientists with a comprehensive collection of thoroughly tested up-to-date manuals for investigating RNA-protein complexes in vitro. The protocols can be performed by researchers trained in standard molecular biological techniques and require a minimum of specialized equipment. The procedures include recommendation of suppliers of reagents.

Cover 1
TOC$Contents 8
Preface 6
CH$Chapter 1. Introduction to RNA-protein interactions 12
1.1. Introduction 12
1.2. RNA secondary structures 12
1.3. RNA tertiary structures 16
1.4. Protein motifs involved in RNA binding 17
References 22
CH$Chapter 2. Preparation of RNA 24
2.1. Working with RNA 24
2.2. Isolation of RNA from cells 30
2.3. In vitro synthesis of RNA 43
References 64
CH$Chapter 3. Preparation of protein 68
3.1. Isolation of protein from cells 68
3.2. Expression and purification of recombinant proteins in E. coli 76
3.3. In vitro translation 87
References 90
CH$Chapter 4. Preparation and analysis of RNA-protein complexes in vitro 94
4.1. Formation of RNA-protein complexes 94
4.2. Analysis of RNA-protein complexes 95
4.3. Isolation and identification 107
4.4. RNA footprinting 121
4.5. Protein footprinting 158
4.6. Modification interference 172
4.7. SELEX 180
References 187
CH$Chapter 5. Functional analysis of RNA-protein complexes in vitro 192
5.1. Pre-mRNA splicing 192
5.2. Polyadenylation 215
5.3. RNA modification 221
5.4. Translation 231
References 242

Erscheint lt. Verlag 13.11.1998
Sprache englisch
Themenwelt Informatik Weitere Themen Bioinformatik
Naturwissenschaften Biologie Biochemie
Naturwissenschaften Biologie Genetik / Molekularbiologie
Technik Umwelttechnik / Biotechnologie
ISBN-10 0-08-088696-5 / 0080886965
ISBN-13 978-0-08-088696-1 / 9780080886961
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